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針對台塑集團不再透過「私立學校興學基金會」捐款，教育部長吳清基表示，過去台塑捐助對象，大部分是長庚大學和長庚技術學院等指定學校，一般大學不受影響。至於原先受捐助的長庚大學和長庚技術學院等校，因為王永慶曾捐贈許多股票，學校目前財務也沒受影響。

吳清基表示，教育部對於私校也設有獎補助款，且學校學費也可有一定比率做為學生獎助學金，加上還有社會其他捐款，不會因台塑沒捐款，就使私校學生的補助受損。

教育部高教司說，王永慶家族自91年至96年捐贈基金會超過178億元，占所有捐款95%。他過世後，97年僅以其他家人名義捐贈1千萬元，98年則未捐款。

私立學校興學基金會主要收入來源為基金孳息，因近年銀行存款利率降低，孳息收入不足以維持該會運作所需費用。為使基金會業務能順利運作，教育部已於去年底修法，增列興學基金會行政經費來源得由政府編列預算補助，今年預計補助150萬元，業務可正常運作。

私立學校興學基金會依私校法第62條成立，目的促進私立學校發展，辦理個人或營利事業對私校捐贈事宜，與一般文教基金會提供獎助學金予弱勢學生不同。